Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CltbQ6IRU5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms