Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt40Q6IFX3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Krt40Q6IFX3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Krt40Q6IFX3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Krt40Q6IFX3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Krt40Q6IFX3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Krt40Q6IFX3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Krt40Q6IFX3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt40Q6IFX3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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