Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca2Q6DIC0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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