Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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