Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp9bQ66X22 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms