Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Trim28Q62318 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim28Q62318 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Trim28Q62318 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim28Q62318 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim28Q62318 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim28Q62318 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim28Q62318 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms