Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Kdm5dQ62240 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5dQ62240 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms