Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rbm38Q62176 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rbm38Q62176 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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