Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms