Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
AtrxQ61687 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms