Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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