Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms