Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tfap2bQ61313 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms