Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mre11Q61216 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms