Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbbp4Q60972 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms