Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot7Q60809 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms