Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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