Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc5a6Q5U4D8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms