Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbs12Q5SUD9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms