Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbm27Q5SFM8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms