Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms