Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spire1Q52KF3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms