Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pdp2Q504M2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pdp2Q504M2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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