Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacs2Q3V3Q7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacs2Q3V3Q7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacs2Q3V3Q7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacs2Q3V3Q7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacs2Q3V3Q7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacs2Q3V3Q7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacs2Q3V3Q7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Pacs2Q3V3Q7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacs2Q3V3Q7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacs2Q3V3Q7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pacs2Q3V3Q7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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