Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ulk4Q3V129 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms