Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC051142Q3V0M8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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BC051142Q3V0M8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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