Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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