Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ttc9Q3V038 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttc9Q3V038 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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