Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Capn13Q3UW68 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Capn13Q3UW68 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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