Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm28047Q3US59 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28047Q3US59 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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