Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf48Q3US17 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf48Q3US17 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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