Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b2Q3UJB0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms