Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf180Q3U827 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms