Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hace1Q3U0D9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms