Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
InipQ3TXT3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms