Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Jmjd8Q3TA59 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Jmjd8Q3TA59 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Jmjd8Q3TA59 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Jmjd8Q3TA59 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Jmjd8Q3TA59 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Jmjd8Q3TA59 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Jmjd8Q3TA59 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Jmjd8Q3TA59 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Jmjd8Q3TA59 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Jmjd8Q3TA59 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms