Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cers3Q1A3B0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cers3Q1A3B0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms