Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpusd2Q149F1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rpusd2Q149F1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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