Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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VgfQ0VGU4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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VgfQ0VGU4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VgfQ0VGU4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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