Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli2Q0VGT2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms