Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Itgb8Q0VBD0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms