Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pglyrp4Q0VB07 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms