Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rab42Q0PD08 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms