Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vps8Q0P5W1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps8Q0P5W1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms