Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Neurl1bQ0MW30 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Neurl1bQ0MW30 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms