Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc21bQ0HA38 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Ttc21bQ0HA38 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms