Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
F13bQ07968 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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F13bQ07968 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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F13bQ07968 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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F13bQ07968 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
F13bQ07968 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms