Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn3Q07409 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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