Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms