Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah1bQ06985 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms